ตั้งแต่วันที่ 14 ก.พ. 2540 ในขณะนี้ ได้มีการเปิดสอนทางไกลร่วมกัน (Cyber Course) ในวิชา Industrial Biotechnology สำหรับนักศึกษาชั้นปีที่ 4 ของคณะวิทยาศาสตร์ สาขาเทคโนโลยีชีวภาพ ชีววิทยา และพฤกษศาสตร์ โดยเปิดทำการสอบในช่วง พ.ย. 2545 - ก.พ. 2546 โดยมีคณาจารย์ทั้งทาง Osaka University และ ม.มหิดล ร่วมทำการสอน

นอกจากนี้ทั้งสองมหาวิทยาลัย ได้เริ่มโครงการความร่วมมืออย่างใกล้ชิด โดยได้ร่วมกันจัดตั้ง Mahidol University-Osaka University Collaborative Research Center for Bioscience and Biotechnology (หน่วยความร่วมมือการวิจัยด้านวิทยาศาสตร์ชีวภาพและเทคโนโลยีชีวภาพ แห่งมหาวิทยาลัยมหิดลและมหาวิทยาลัยโอซาก้า) และจากความร่วมมือต่างๆ แสดงให้เห็นถึงความร่วมมืออย่างใกล้ชิดของทั้งสองมหาวิทยาลัย ทำให้ทางมหาวิทยาลัยโอซาก้า ได้ดำเนินการจัดตั้ง Cooperative Research Station in Southeast Asia (หน่วยร่วมมือการวิจัยสำหรับประเทศในตะวันออกเฉียงใต้) ซึ่งเป็นสาขาของ International Center for Biotechnology (ICBiotech), Osaka University (ศูนย์นานาชาติด้านเทคโนโลยีชีวภาพแห่งมหาวิทยาลัยโอซาก้า) ซึ่งเป็นสาขาแห่งแรกของหน่วยงานดังกล่าว ของมหาวิทยาลัยโอซาก้าที่ตั้งอยู่นอกประเทศญี่ปุ่น ที่คณะวิทยาศาสตร์ มหาวิทยาลัยมหิดล เพื่อเป็นหน่วยงานความร่วมมือการวิจัย ระหว่างนักวิจัยของมหาวิทยาลัยมหิดลและมหาวิทยาลัยโอซาก้า รวมทั้งนักวิจัยจากประเทศในตะวันออกเฉียงใต้ ซึ่งในอนาคตจะมีนักวิจัยจากมหาวิทยาลัยต่างๆในประเทศไทย, จากมหาวิทยาลัยต่างๆของประเทศในตะวันออกเฉียงใต้ รวมทั้งจะมี Visiting Professor จาก Osaka University มาประจำที่ศูนย์ทั้งสอง ดังกล่าวอย่างต่อเนื่อง