Webboard : SCID 141/142 Q&A

Date Content
07-02-2017 11:39:51
Please leave your questions here
07-02-2017 12:09:47
08-02-2017 00:48:49
Yes, of course I can. But I won't 'cos I think challenging oneself would make one improved further. We will have Q&A in Thai.
one of the students
10-02-2017 10:17:13
How different between primase and primosome ? They are not identical but have a same function which create RNA primer or they are same thing? Thank you
10-02-2017 15:22:17
Thank You
A student of yours
11-02-2017 10:27:57
Hello there, 
Since all promoter sequences are written in 5'->3' by convention and the mRNA must be synthesized in a 5'->3' direction, does this mean that the promoter recognized by transcription factors or sigma factors would always be on the non-template strand and the other strand would always be the one transcribed? Thank you in advance. ^_^ 
11-02-2017 19:56:06
อาจารย์คะ ถามนอกบทนิดนึงนะคะ คือว่าทำไมoaaที่ตับที่มาจากlactateถึงใช้PEPCK-Mได้อะคะ PEPCK-M กับ PEPCK-C มันต่างกันยังไงบ้างหรอคะ ขอบคุณล่วงหน้าค่ะ (^∇^)
A student of yours
12-02-2017 09:56:00
อาจารย์คะ สงสัยเกี่ยวกับmechanism of action of telomeraseว่าทำไมleadind standถึงสายไม่สั้นลงเหมือนlagging standทั้งๆที่leading standก็ใช้RNA Primerเพื่อเริ่มต้นให้DNA pol||ทำงานเหมือนกับlagging stand
12-02-2017 13:22:32
is protonatedกับ is deprotonatedต่างกันไงครับ(รบกวนขออธิบายเป็นภาษาไทยนะครับ)
13-02-2017 16:36:23
Primase/primosome --> already addressed in the lecture

Promotors --> When we write down the sequences, we usually write them in 5' --> 3'. For example, TATA box contains 5'-TATAAA-3'. However, when the RNA polymerase binds to the promoter to form transcriptional initiation complex, it binds to both strands and start strand separation, then synthesize the RNA in 5'-3' direction.

PEPCK-M/C --> I didn't cover this topic in my lecture. Please consult the one who teaches this topic. From my understanding, they both function in the same way, but their expression and localization are different. The cells mainly use PEPCK-C, but not -M form, however, the generation of PEP via PEPCK-M may occur via a metabolic sensing pathway important for regulating both insulin secretion and gluconeogenesis.

Telomerase --> Please see the figure at the following link

Protonated is the addition of a proton (a hydrogen cation, H+) while deprotonation is the removal (transfer) of a proton.
e.g. AH + B --> A-  +  BH+ 
AH is deprotonated to A-
B is protonated to BH+
14-02-2017 11:54:03
Please explain the difference between TATA box and TATA Young. Thank you.
BM ไงจะใครล่ะ
15-02-2017 00:14:28
สอบถามคับ ไม่เข้าใจว่าทำไมในการทำ genomic libraries ถึงต้องใช้ enzymes ตัดอย่างfrequentlyด้วยคับ
PIlot 22/7
22-02-2017 14:19:20
Dear Ajarn Tavan
How can I translate "First Acceptor" in term of Thai language
Thank you
//sorry for my bad English
22-02-2017 16:46:51
น้องทาม about Tata Young and TATA box, this is a good question. I might put this in the exam and your friends can help answer it.

I already clarified about the genomic library in the lecture.

For the first acceptor, I presume that it's about splicing right? If so, the first acceptor is at the first nucleotide of the intron at the 5'splice site. This means it accepts an electron pair.
22-02-2017 18:35:49
Midterm ออกสอบถึงบทไหนอ่าครับ
23-02-2017 17:07:54
SCID 141: Lectures 1 - 8
SCID 142: Labs 1 - 2
Conferences 1 - 2
03-03-2017 15:12:12
03-03-2017 15:31:21
ชิตังเม โป้ง F
03-03-2017 15:42:57
Nice haircut kub
10-03-2017 11:44:41
Best examination ever kub.

Thank you for referring Amita Tata young in the exam, she is my favorite singer. Also thank you for many helpful tutorials kub

Best regards.

10-03-2017 18:18:30
Glad to hear that you and friends enjoyed the midterm. Hope you all get good scores.
22-03-2017 06:55:15
สงสัยว่าการควบคุม TCA cycle ทำไมถึงถูกควบคุมโดยขั้นที่เป็น irreversible อะครับ? ขอบคุณครับ

23-04-2017 20:44:52

เป็นขั้นที่ไม่ผันกลับแทบทั้งนั้น ไม่ใช่เฉพาะ
TCA cycle เช่น glycolysis/gluconeogenesis เนื่องจากการควบคุมในจุดที่ผันกลับได้
จะส่งผลต่อเปลี่ยนแปลงอัตราการเกิดปฏิกริยาทั้งด้านไปและกลับ จึงไม่เห็นผลต่อการเปลี่ยนแปลงสุทธิ

30-01-2018 12:23:14
Luv u
30-01-2018 23:20:07
อาจารย์ค่ะ ระหว่างเบสแต่ละตัวเป็นไฮโดรเจนบอนด์ แต่ทำไม stacked bases ถึงมีสมบัติเป็น hydrophobic ละครับ
31-01-2018 22:12:49
คุณ Luv u ดูจะสับสนเล็กน้อยนะครับ ขึ้นต้น อาจารย์ค่ะ (should be คะ?) ลงท้ายด้วยครับ 

สำหรับคำถามนี้ สามารถหาคำตอบได้จาก


อธิบายไว้ละเอียดมากครับ most important interaction in base stacking is electrostatic complementarity (with also van der waal force)
18-02-2018 14:29:38
เรื่อง DNA replication ในstudy questions ข้อ2 ช้อยข้อA เขียนว่า ribonucleoprotein provides the DNA จริงๆแล้วไม่ใช่ RNAหรือคะ ขอบคุณล่วงหน้าสำหรับคำตอบค่ะ
18-02-2018 20:38:38
Well spotted! 

Choice A should be 'Telomerase, a ribonucleoprotein, provides both the RNA and the polymerase needed for synthesis.'
Cute little student
02-03-2018 01:01:51
Dear Aj. Tawan,
Please can you explain the difference between cis/trans-acting ELEMENT and cis/trans- acting PROTEIN.  I think I heard something in the lecture like nonconding proteins are cis acting protein and the active proteins are trans-acting protein. To me, this is a little confusing. Isnt it the relative position betweenwhere they are produced and where they make action? Although, I didnt quite catch that so I might get it wrong. Thank you in advance. 
04-03-2018 00:40:46
From the text, cis acting elements are regions on (non-coding) DNA that bind to trans acting proteins to regulate the transcription.

Cute bear
09-03-2018 14:35:57
อาจารย์คับ ช่วยอวยพรในการสอบหน่อยค่ะ
09-03-2018 14:37:23
Which  types of DNA move rhe furthest

09-03-2018 22:33:43
@Cute bear: Wishing you the best of luck for this coming midterm.

Unknown quote: Exams and grades are temporary, but education is permanent.

RAMD student
11-03-2018 16:18:09
Q: Translation of a synthetic polyribonucleotide containing the repeating sequence CAA in a cell-free
protein-synthesizing system produces three homopolypeptides: polyglutamine, polyasparagine, and
polythreonine. If the codons for glutamine and asparagine are CAA and AAC, respectively, which of the
following triplets is the codon for threonine? 

a. AAC b. ACA c. CAA d. CAC e. CCA

Why is the answer being b. ACA? I don't understand what does the question try to tell me.

12-03-2018 16:10:17
The genetic codes appear in triplet. In this case, the repeating sequence CAA should be ...CAACAACAACAACAACAA...

This sequence can be translated into 3 homopolypeptides :-
Glutamate: ...CAA CAA CAA CAA CAA...
Asparagine: ...C AAC AAC AAC AAC AA...
Threonine: ...CA ACA ACA ACA ACA A...

Basically it plays with three reading frames of the possible codons. Hope this will help.
18-03-2018 00:08:36
19-03-2018 01:31:31
24-04-2018 14:19:55
คนที่เป็นโรคขาดเอนไซม์ G6PD ที่ใช้ในการสร้าง pentose
เค้าเอา pentose ที่ใช้สร้าง DNA RNA ATP พวกนี้มาจากไหนหรอครับ ผ่านทางการกินหรอครับ ขอบคุณมากครับ
27-04-2018 02:07:33
ในสมองมีกระบวกการ glycolysis หรือป่าวคะ แล้วถ้าไม่มี มันใช้glucose โดยวิธีไหน ขอบคุณมากคะ
27-04-2018 02:16:04
อ.ครับ อยากถามว่า ในสมองใช้แหล่งพลังงานจากกลูโคส แล้วถ้ากลูโคสต่ำ มันสามารถทำ gluconeogenesis ได้มั้ยครับ
แล้วถ้ามันทำได้ คือหมายความว่า มันทำ gluconeogenesis แล้วได้ glucose แล้วไป glycolysis ต่อ อย่างนั้นมั้ยครับ
30-04-2018 15:31:50
คำตอบจาก อ.ตวงพร นะครับ 

1. ในสมองมีกระบวกการ glycolysis หรือป่าวคะ
Ans. มีค่ะ สมองใช้กลูโคสโดยไกลโคไลซิส วัฏจักรเครบ และ oxidative phosphorylation ดังนั้นกลูโคสและออกซิเจน จึงสำคัญในการทำงานของสมอง

2. คนที่เป็นโรคขาดเอนไซม์ G6PD ที่ใช้ในการสร้าง pentose
เค้าเอา pentose ที่ใช้สร้าง DNA RNA ATP พวกนี้มาจากไหนหรอครับ
Ans. Pentose สามารถสร้างจาก non-oxidative phase ของ PPP คือ transketolation/transaldolation ของน้ำตาล C6 ได้ค่ะ


หาก นศ มีคำถามเพิ่มเติม สามารถเก็บมาถามในชั่วโมง tutorial ได้ครับ
RAMD Student
11-05-2018 11:05:54
1. กระบวนการ gluconeogenesis เกิดได้ที่ไหนบ้างครับนอกจากตับ
2. Antimycin A ยับยั้งการส่งผ่านอิเล็กตรอนที่ Complex ไหนของ Electron transport chain ครับ

12-05-2018 10:56:56
To RAMD student,

Just a quick search.

1. In vertebrates, gluconeogenesis takes place mainly in the liver and, to a lesser extent, in the cortex of the kidneys.

2. Antimycin A binds to the Qi site of cytochrome c reductase, inhibiting the oxidation of ubiquinone in the Qi site of ubiquinol thereby disrupting the Q-cycle of enzyme turn over. 
Student MDMU
18-05-2018 22:58:30
อยากจะถามว่า การ tranamination มันเกิดที่ cytoplasm  ซึ่ง AST มันก็เป็น enzyme ในกระบวนการนี้ แต่ทำไม AST มันถึงได้เป็น marker enzyme in mitochodria ได้คะ  ตอนแรก เข้าใจว่า มันได้ OAA ซึ่งจะต้องเข้า mitochondria แต่ในกระบวนการ tranamination มันอยู่ใน cytoplasm
Love biochemistry
18-05-2018 23:42:28
อาจารย์คะ extrahepatic tissue มันไม่มี glutamate dehydrogenase ใช่มั้ยคะ มันถึงเกิด urea cycle ไม่ได้ 
19-05-2018 00:14:44
 ทำไมเอา glutamate จาก cell อื่น มายังตับโดยตรงไม่ได้ ทำไม ต้องผ่าน glutamine ก่อนคะ
19-05-2018 20:23:53
ใน lab Cholesterol เราใส่ ethanol เพื่ออะไรเหรอครับ

Reply : SCID 141/142 Q&A